自由意志可以起源于两种相互作用的算法系统，因为这样的系统可以创造选择的机会。人类对人工智能的恐惧根植于自由意志是否存在的疑问。自由意志可以意外的在算法中出现，这令人类感到威胁。自由意志有可能作为一种大脑产生的错觉，用它来解释行为令人担忧。如果机器在某些方面接近自由意志，这将表明自由意志可能会在算法中诞生，并且在无意中出现。各类科幻电影为这类担忧提供了许多强有力的文化表达。
自由意志有能力在不依赖外部agent，例如命运或天意等条件下作出选择。如果人们根据他们的要求作出某些决定，那么这就是自由意志；然而，如果人类的选择仅仅是遵循根据某些行为设定的模式，那么就没有自由意志。例如，如果一个人感到恐惧，他或她看起来需要在战斗和逃跑之间做出选择。如果这个人把选择权交给一个算法，那么尽管可以二选其一，但他或她将永远只会做出一种特定的选择，他们没有自由意志。
卡尔·荣格和弗洛伊德都注意到人类的内在驱动问题，那就是生存和性，它们永远不会为外部因素所动摇。荣格更进一步用这个概念对善良和邪恶作出了解释。看来似乎很明确，生物大脑的某些组成部分与环境之间的互动是完全的算法问题，例如人类的反射，这些需求并没有经过意识的推理。此外，荣格的观点还提到大脑的新皮层也存在一种算法。这种观点认为人有先天的感受器，包括道德和自由的概念，它们都能支配行为。
这里有一个疑问，那些按照算法发生的事情与那些在算法之外发生的事情之间的联系在那里？以及是否所有的真实事物都游离于算法之外？自我意识可能不会产生自由意志的原因是因为他不能保证拥有作出选择的能力。电影人工智能令人想到自我觉醒的事物可能并不总是拥有自由意志，当人们以破坏机器人为乐时，只有大卫乞求自己的生命。他并没有乞求的程序，但来自外部的输入令他感到害怕，并迫使他那样做。这允许他去做一些在外部观察者看来是有选择的行为。尽管如此，他的算法可能仅仅只是变得更复杂了。这个场景代表恐惧，如果机器可以模拟自由意志，那么可能自由意志只是人类的一种极其复杂的算法。
人类乐于见到这样的观点，即自由意志并非无意中出现的。尽管演化是必要的，但其他的一些理论，例如智能设计理论认为有一个智能的造物主渴望看到这一结果。如果机器能够产生自由意志，那么它不仅仅将会替代一些人类独一无二的地位，而且也表明自由意志的出现并不需要依赖一个智能的造物主。人们害怕这个发现。在电影westworld和Blade Runner中都表现了这一想法。在westworld中，一个度假地点的类人机器人开始表现出一些超出他们程序的行为，他们对于自己被用于娱乐感到愤怒。当那个人听说机器开始自由行动并攻击客人时他感到恐惧，并逃离了那里。电影Blade Runner表现了一些学习感受情感的人工智能机器，他们开始有了自主行为。人类因此开始害怕他们，并对他们的生命进行全面限制。尽管这两个电影都表现那些机器人用自由意志去杀戮的暴力场面，但更大的恐惧仍然来自机器在无意中发展出自由意志的担忧
仍然是那个问题，两种互相作用的算法是否会产生自由意志。如果确实如此，那么人类和机器就都有能力产生自由意志。对于大脑皮层产生的某个场景，自由意志有能力作出选择。因为在人类在类似的场景中表现出了获取不同路径的能力，这让人感觉那些选择并不是可以完全预测的。例如，出于多种因素，学生们为了应付考试可以选择复习或不复习。对于下一次考试要不要复习，这次考试的好成绩可能会起到积极的督促作用。有大量的变数影响人的主观判断，这些复杂的变数使得即便对于独立的个体来说也没有设定的行为模式。人们可能会跟随潮流，然而，通常他们还会保留一些从潮流中脱身的能力。这意味着没有设定的算法，自由意志是存在的。
自由意志意味着选择不为外界因素所动，这说明人们的创造能力深受其所处社会的影响。先天的道德观念提供了行为的指导，它将会对判断作出强烈的影响，此外人们的个性也将会影响行为模式。然而，没有这些因素，人们也可能完全控制自己的行为。当人们犯罪时，他们就挑战了一些先天的道德观念，但这仍然来源于自由意志。
通过算法与环境的交互对话，人或机器都可能存在自由意志。假如自由意志存在，那么它是否有意产生的并不重要。人类拥有在两个选项中择其一的能力，因此人类有自由意志。在任何其他事物中出现自由意志也并非威胁。自由意志这个概念在人类中偶然被发现已经超过一百五十年，并且现在它逐渐为人们所公认。就像达尔文的进化论以及哥白尼的日心说一样，人类终将认识到自己并非像从前所想的那样，是宇宙中的唯一生灵。一旦这个观点得到公认，人们就不会再害怕人工智能，并且人工智能可能真的会拥有自由意志。
